Výpočetní metody v makromolekulární krystalografii

Monokrystalová difrakce je stále nejpoužívanější metodou pro získávání strukturních informací o biologicky aktivních molekulách. Pomocí této metody se můžeme dozvědět mnoho cenných informací o buněčných procesech, imunitním systému, evoluci, ale také o možných aplikacích pro biotechnologický průmysl.

Jako mnoho dalších fyzikálních oborů, makromolekulární krystalografie prochází neustálým vývojem a to jednak v oblasti vylepšování experimentálního zařízení (konvenční zdroje, synchrotrony, lasery s volnými elektrony, detektory záření), ale také v oblasti zpracování naměřených dat.

V současné době nabízíme tato dvě témata:

• Identifikace slabě vázaných ligandů makromolekul.
• Analýza a škálování dat anisotropně difraktujících krystalů.

Nadále chceme rozvíjet program, který pomáhá jiným uživatelům správně rozpoznávat signál difrakčních dat - PAIREF.

Kontakt:
doc. Ing. Petr Kolenko, Ph.D.
Katedra inženýrství pevných látek FJFI ČVUT
petr.kolenko#fjfi.cvut.cz
00420 224 358 606
kmlinux.fjfi.cvut.cz/~kolenpe1

Tento projekt je řešený spolu s Biotechnologickým ústavem AV ČR, v.v.i., který sídlí v centru BIOCEV ve Vestci u Prahy. Spolupracujeme především s Laboratoří struktury a funkce biomolekul pod vedením Ing. Jana Dohnálka, Ph.D.