You are here
11PMK1 - Praktikum z makromolekulární krystalografie 1
| Název předmětu: |
Praktikum z makromolekulární krystalografie 1 |
| Kód předmětu: |
11PMK1 |
| Počet kreditů: |
4 |
| Typ předmětu: |
Volitelný |
| Ročník studia: |
2 Mgr |
| Způsob ukončení: |
kz |
| Semestr: |
zimní |
| Vyučující: |
Kolenko |
| Anotace: |
Cílem praktika je osvojení si metod makromolekulární krystalografie, jako je krystalizace v různých podmínkách, zvládnutí obsluhy a zpracování difrakčního experimentu a jeho vyhodnocení. Tato převážně experimentální část je plánována za zimní semestr. V rámci druhé části, letního semestru, se jedná převážně o počítačová praktika zaměřená na řešení fázového problému různými metodami, zpřesňování shody mezi experimentem a modelem makromolekuly a o kontrolu kvality výsledné struktury. Závěrečná část praktika se zaměřuje na práci s databázemi, sběr a porovnání informací z různých zdrojů. |
| Sylabus: |
1.Metody charakterizace makromolekul v roztoku 2.Krystalizace makromolekul 3.Obsluha difraktometru, difrakční experiment 4.Vyhodnocení difrakčních obrazů 5.Řešení fázového problému - metoda molekulárního nahrazení, experimentální fázování 6.Upřesňování makromolekulárních struktur 7.Kontrola kvality výsledné geometrie makromolekul a shody s experimentálními daty 8.Databáze |
| Literatura: |
Povinná literatura:
J. Marek, Z. Trávníček: Monokrystalová rentgenová strukturní analýza. Univerzita Palackého v Olomouci, Olomouc, 2002.
Doporučená literatura:
V. Valvoda, M. Polcarová, P. Lukáč. Základy strukturní analýzy. Karolinum, Praha, 1992.
I. Kraus: Struktura a vlastnosti krystalů. Academia, Praha, 1993. |